氨基酸生物有機肥的有效施肥深度一般在根系密集區，即土表層下15厘米左右，并要根據土壤性質(zhì)、作物種類(lèi)、氣候條件和施肥方法而調整和改變。從土壤性質(zhì)來(lái)看，粘土地應施肥翻耕的淺一些。在砂土上，因通氣、透水性好，氨基酸生物有機肥相對可以施的較深些。從作物種類(lèi)看，果樹(shù)等植株根系較深的，施肥則要深，而對小白菜等根系較淺的蔬菜作物，施肥淺有利于作物吸收。從氣候條件看，降雨少的地區或旱季，施肥后翻耕可深些。溫暖而濕潤的地區或雨季，翻耕則應淺些。從施肥方法看，種肥、基肥和追肥的施肥深度不同，種肥要與作物種子在土壤中的深度相適應，才能達到施用種肥的目的。
